针对您提出的“门诊病假单不能作为延续长病假算旷工怎么办”这一问题，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确的是，病假是指职工因病或非因工负伤，经医生建议、公司批准停止工作治病休息的期间。病假的认定，具有特殊性，应由专业医疗机构决定劳动者是否需要休息，而不是由公司进行病情的实质审核。
针对您的情况，如果门诊病假单不能作为延续长病假的依据，而被公司算作旷工，这可能涉及到以下几个方面的争议：
病假申请流程：
- 您需要确认自己是否按照公司的规定，提前提交了书面病假申请，并附上了门诊病假单等相关证明材料。
- 如果公司有特定的病假申请流程或要求，您需要确保自己已经完全遵守。
病假单的合法性：
- 门诊病假单应由正规医疗机构出具，并包含医生的建议休息时间。
- 如果公司对病假单的合法性或真实性有疑问，可以要求您提供进一步的证明材料，如病历、检查报告等。
公司的规章制度：
- 您需要仔细阅读公司的规章制度，了解关于病假申请、审批以及旷工认定的具体规定。
- 如果公司的规章制度中明确规定了门诊病假单不能作为延续长病假的依据，或者对病假申请有特定的要求，您需要确认自己是否已经遵守。
劳动者的权益：
- 劳动者拥有生命健康权，且必须得到充分保障。在依法取得病假的情况下，劳动者应当享有休息休假权。
- 如果公司以不合理的理由拒绝批准病假，或者将门诊病假单算作旷工，这可能侵犯了劳动者的合法权益。
针对以上争议点，我建议您采取以下措施：
与公司沟通：
- 首先，您可以尝试与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，解释自己的情况，并提供进一步的证明材料。
- 强调门诊病假单是由正规医疗机构出具的，且医生已经建议了休息时间。
查阅法律法规：
- 如果沟通无果，您可以查阅相关的劳动法律法规，了解自己的权益和公司的义务。
- 确认公司是否违反了劳动法律法规中关于病假申请、审批以及旷工认定的规定。
寻求法律援助：
- 如果公司仍然坚持将门诊病假单算作旷工，您可以考虑寻求法律援助，如咨询律师或向劳动仲裁机构提起仲裁。
- 在法律援助的过程中，提供充分的证据材料来支持自己的主张。
最后，我想强调的是，作为劳动者，您有权依法享受病假待遇，并保障自己的生命健康权。如果公司以不合理的理由拒绝批准病假或侵犯您的合法权益，您有权采取相应的措施来维护自己的权益。