事业单位工作人员注册公司，如果违反相关规定从事营利性活动，是有可能被发现的。具体分析如下：

一. 事业单位工作人员注册公司的风险

1. 违反规定：根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第十八条，事业单位工作人员违反国家规定，从事、参与营利性活动或者兼任职务领取报酬的，将面临警告、记过、降低岗位等级、撤职乃至开除的处分。这表明，事业单位工作人员注册公司并从事营利性活动，是明确违反规定的。
2. 监管与发现：事业单位通常对其工作人员有一定的监管机制，包括但不限于定期审计、举报机制等。如果工作人员注册公司并从事营利性活动，这些活动有可能在审计或举报过程中被发现。此外，随着信息技术的发展，相关监管部门的监管手段也在不断加强，使得违规行为更易于被察觉。

二. 建议与警示

1. 遵守规定：我建议事业单位工作人员严格遵守国家相关法律法规和单位规定，不从事违反规定的营利性活动。如果确有创业或投资需求，应事先咨询单位相关部门或领导，确保自己的行为符合规定。
2. 风险意识：事业单位工作人员应增强风险意识，认识到注册公司并从事营利性活动可能带来的法律风险和职业风险。一旦被发现违规，不仅可能面临法律制裁，还可能对职业生涯造成严重影响。

综上所述，事业单位工作人员注册公司并从事营利性活动是有可能被发现的，且一旦被发现将面临严重的法律后果。因此，我建议事业单位工作人员务必遵守相关规定，避免违规行为的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。