首先，我们需要明确一点：医院在编职工在本单位兼职是否违法，主要取决于具体的法律法规以及单位内部的规章制度。接下来，我将从几个方面详细分析这个问题，并给出相应的处理建议。

1. 法律法规层面：

   • 根据我国《劳动合同法》等相关法律法规，并没有明确禁止医院在编职工在本单位兼职的规定。但是，这并不意味着所有情况下都可以兼职，因为还需要考虑单位内部的规章制度以及兼职是否会影响本职工作等因素。
   • 如果兼职行为违反了相关法律法规（如涉及不正当竞争、侵犯商业秘密等），那么将可能面临法律责任。

2. 单位规章制度层面：

   • 医院作为事业单位，通常会有自己的规章制度来管理职工的行为。这些规章制度中可能会明确禁止或限制职工在本单位兼职。
   • 如果医院规章制度中明确规定了禁止兼职，那么职工应当遵守，否则可能会面临单位内部的纪律处分，如警告、记过、降职、辞退等。

3. 兼职对本职工作的影响：

   • 即便法律法规和单位规章制度没有明确禁止兼职，职工也需要考虑兼职是否会影响自己的本职工作。如果兼职导致本职工作无法完成或质量下降，那么单位有权根据相关规定进行处理。

处理建议：

• 了解法律法规和单位规章制度：首先，建议医院在编职工仔细了解相关法律法规和单位内部的规章制度，明确自己是否有兼职的权利和义务。
• 与单位沟通：如果职工有兼职的意向，建议提前与单位相关部门进行沟通，了解单位对兼职的态度和政策，并按照规定办理相关手续。
• 合理安排时间：如果兼职得到允许，职工需要合理安排时间，确保兼职不会干扰到本职工作，保持工作质量和效率。
• 遵守法律法规和道德规范：在兼职过程中，职工应当遵守相关法律法规和道德规范，不得从事违法违规的活动，维护单位和个人的声誉和利益。

总之，医院在编职工在本单位兼职是否违法以及如何处理，需要根据具体的法律法规、单位规章制度以及兼职对本职工作的影响来综合判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。