合作协议中的违约金过高，合同是可以拒绝签署的。下面我将从法律角度为您详细解释这一观点：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人在订立合同时，应当遵循公平原则确定各方的权利和义务。违约金作为合同中的一项条款，也应当遵循这一原则。
   • 如果合作协议中约定的违约金数额过高，明显超出了合同实际履行所能带来的利益或损失，那么这样的条款可能被视为显失公平，从而影响合同的效力。

2. 实际操作：

   • 在面对违约金过高的合同时，您可以首先尝试与对方进行协商，寻求降低违约金的数额或调整违约金的计算方式，以使其更加合理和公平。
   • 如果协商无果，您可以选择拒绝签署该合同，以避免未来可能因违约金过高而带来的法律风险和经济负担。

3. 法律建议：

   • 在签署任何合同之前，务必仔细阅读合同条款，特别是关于违约金、违约责任等方面的约定，确保自己的权益得到充分保障。
   • 如果您对合同条款存在疑问或不确定之处，建议咨询专业律师进行审查和指导，以确保合同的合法性和有效性。

综上所述，合作协议中的违约金过高时，您完全有权拒绝签署该合同。在签署合同前，请务必谨慎审查合同条款，并寻求专业法律意见以确保自己的权益。