如合作协议中明确订立了违约金条款，一方违约时，另一方有权依照协议约定要求违约方承担违约金责任。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一. 违约金的承担

1. 依据协议要求违约金：若合作协议中已明确规定了违约金，当一方违反协议条款时，另一方可以依据协议中的约定，要求违约方支付相应的违约金。《民法典》第五百八十五条规定：“当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金”。
2. 违约金的合理性：违约金的数额应当合理，如果违约金过高或过低，与实际损失不符，违约方有权请求法院或仲裁机构进行适当调整。

二. 违约金的支付与谈判

1. 支付条件与证据：在要求违约方支付违约金前，应仔细审查协议中关于违约金的支付条件、衡量标准等条款，并确保有足够的证据支持违约事实。《民法典》第五百七十七条规定了违约方应承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任，这包括支付违约金。
2. 谈判与协商：如果违约方对违约金有异议，或无力支付，双方可以尝试进行谈判，协商违约金的支付方式、时间或金额。但任何协商结果都应形成书面记录，以避免后续纠纷。

三. 法律途径

1. 诉讼或仲裁：若谈判无果，守约方可以通过法律途径，如向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，要求违约方承担违约金责任。《民法典》为守约方提供了法律保障，允许其通过司法程序维护自身权益。
2. 执行措施：在获得法院或仲裁机构的裁决后，若违约方仍不履行支付义务，守约方可以申请强制执行，法院将采取相应措施确保裁决的执行。

综上所述，如合作协议中明确规定了违约金，一方违约时，另一方应依据协议约定要求违约方承担违约金责任，并可通过谈判、法律途径等方式确保自身权益得到维护。如有进一步需要，您可以继续咨询我。