当员工在医疗期满后，如果用人单位因特定原因需要辞退该员工，补偿方式主要依据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规进行。以下是对您问题的详细解答：
一、法律依据
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十条：在特定情况下，如劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条：用人单位依照上述第四十条的规定解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿。
二、补偿内容
经济补偿金：
- 按照劳动者在本单位工作的年限来支付，具体为每满一年支付一个月工资的标准。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资的经济补偿。
- 如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿金的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，但支付年限最高不超过十二年。
代通知金：
- 如果用人单位没有提前三十日以书面形式通知劳动者就解除劳动合同，那么除了经济补偿金外，还需要额外支付劳动者一个月工资作为代通知金。
医疗补助费（并非所有地区都执行，具体需根据当地政策）：
- 在某些情况下，如劳动者经劳动能力鉴定委员会确认不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作而解除劳动合同，用人单位可能需要根据劳动者的实际情况支付一定的医疗补助费。
三、特殊情况
- 如果用人单位违反法律规定解除劳动合同，劳动者有权要求继续履行合同或者选择不要求继续履行合同，并要求用人单位依照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。
四、实际操作建议
- 了解当地政策：由于劳动法规在不同地区可能存在差异，建议用人单位和劳动者在处理此类问题时先了解当地的具体政策和规定。
- 保留相关证据：无论是用人单位还是劳动者，在处理此类问题时都应保留好相关证据，如医疗证明、劳动合同、工资单等，以便在发生争议时维护自己的合法权益。
- 协商解决：在可能的情况下，双方可以通过协商的方式解决争议，避免不必要的法律纠纷。
综上所述，休完医疗期后被辞退的补偿方式主要依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定进行，具体补偿内容可能包括经济补偿金、代通知金以及可能的医疗补助费。在实际操作中，建议双方先了解当地政策并保留好相关证据，以便在发生争议时能够有效维护自己的合法权益。