公司管理层加班是否有加班费，需根据具体情况判断。主要取决于其工时制度、劳动合同约定以及公司合法有效的规章制度。以下是详细分析：

1. 标准工时制下的加班费规定：

   • 根据我国《劳动合同法》及相关法律法规，用人单位安排加班的，应当按照国家规定向劳动者支付加班费。这一原则同样适用于管理人员。若管理人员与用人单位签订的劳动合同明确约定适用标准工时制，且实际执行该制度，则在其延长工作时间、休息日工作且未安排补休、法定节假日工作的情况下，用人单位需支付加班费。
   • 具体标准如下：工作日加班支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日加班（不能安排补休）支付不低于工资的200%的工资报酬；法定节假日加班支付不低于工资的300%的工资报酬。

2. 不定时工作制下的特殊情况：

   • 对于部分因工作性质和工作职责限制而难以确定固定工作时间的管理人员，企业可申请实行不定时工作制。在此制度下，由于工作时间不受固定时数限制，通常不存在“加班”概念，因此一般不支付加班费。但需注意，实行不定时工作制必须经过劳动行政部门审批，未经审批擅自实行的，劳动者要求支付加班工资通常会得到司法支持。

3. 综合计算工时工作制的相关规定：

   • 另一种情况是综合计算工时工作制，该制度以标准工作时间为基础，在一定周期内综合计算工作时间。在综合计算周期内，某一日（或周）的实际工作时间可能超过8小时（或40小时），但只要总实际工作时间不超过总法定标准工作时间，就不视为加班。然而，若超过总法定标准工作时间或在法定节假日安排工作，则需按规定支付加班费，其中法定节假日加班费标准为工资的300%。同样，实行此制度也需经过劳动行政部门审批。

4. 劳动合同约定与公司规章制度的考量：

   • 若劳动合同中明确约定了管理层在某些特定加班情形下仍有加班工资，那么应按照合同约定执行。
   • 如果公司有合法有效的规章制度规定了管理层加班有相应报酬及明确的计算方法等内容，也应依此支付加班工资。

5. 加班费计算基数的确定：

   • 加班费的计算基数并不一定是劳动者的全部工资。在确定时，应遵循以下原则：如果劳动合同中对工资有约定，则按不低于约定的工资标准确定；如果劳动合同中没有约定，可由用人单位与员工代表通过集体协商明确；如果无任何约定，则按劳动者本人所在岗位正常出勤月工资的70%确定；但无论何种情况，确定的加班工资计算基数均不得低于最低工资标准。

综上所述，公司管理层加班是否有加班费并非一概而论，而是需根据其具体的工时制度、劳动合同约定以及公司合法有效的规章制度来判断。在任何情况下，管理层的休息休假权利都应得到充分保障。如有具体疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。