针对员工未签入职协议就离职并带走公司机密的情况，公司可以采取以下措施来处理：
一、明确法律责任与后果
民事层面：
- 尽管员工未签入职协议，但如果公司能证明员工确实带走了机密信息，并且这些信息对公司具有商业价值且公司采取了合理的保密措施，那么员工的行为可能构成对商业秘密的侵犯。
- 公司可以要求员工承担民事责任，如赔偿因泄露机密给公司造成的经济损失，包括但不限于直接经济损失、调查费用、律师费用等。
刑事层面：
- 如果员工的行为给公司造成了重大损失，且符合侵犯商业秘密罪的构成要件，公司可以报警，由公安机关立案侦查。
- 一旦构成犯罪，员工将面临有期徒刑、拘役或罚金等刑事处罚。
二、采取具体应对措施
固定证据：
- 公司应首先收集并固定所有与员工带走机密相关的证据，包括但不限于监控录像、电子邮件、聊天记录、文件传输记录等。
- 这些证据将在后续的协商或法律程序中起到关键作用。
与员工协商：
- 在采取法律行动之前，公司可以尝试与员工进行协商，要求其归还机密信息并承担相应责任。
- 协商过程中，公司可以明确表达其立场和诉求，同时给予员工一定的时间考虑和回应。
走法律程序：
- 如果协商无果，公司可以委托专业律师向法院提起诉讼，要求员工承担民事或刑事责任。
- 在诉讼过程中，公司将需要提供充分的证据来证明员工的侵权行为以及由此给公司造成的损失。
加强内部管理：
- 为了防止类似事件再次发生，公司应加强对员工的管理和培训，提高员工的保密意识。
- 同时，公司还应完善保密制度，明确保密责任和义务，确保所有员工都能遵守相关规定。
三、总结与建议
面对员工未签入职协议就离职并带走公司机密的情况，公司应保持冷静并采取有效的应对措施。通过固定证据、与员工协商、走法律程序以及加强内部管理等方式，公司可以维护自身的合法权益并防止类似事件的再次发生。同时，公司也应以此为契机，加强对员工的管理和培训，提高整体的保密意识和能力。