针对“入职没签保密协议，离职补签是否合法”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
一、劳动合同与保密协议的关系
劳动合同的签订：根据《劳动合同法》，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，并应当订立书面劳动合同。劳动合同是保障劳动者实现劳动权益的重要法律形式。
保密协议的性质：保密协议通常作为劳动合同的补充协议，用于约定劳动者对用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项承担保密义务。它并非劳动合同的必备条款，但可以在劳动合同中约定，也可以单独签订。
二、补签保密协议的合法性
补签的时机：入职时未签订保密协议，并不意味着劳动者就无需承担保密义务。如果用人单位在劳动者离职时提出补签保密协议，这本身并不违反法律规定。但补签的协议内容应当合法、合理，且不得侵犯劳动者的合法权益。
劳动者的选择权：劳动者有权选择是否补签保密协议。如果劳动者认为补签协议的内容不合理或侵犯了自己的权益，可以拒绝签订。此时，用人单位不能因此而对劳动者采取不利措施，如扣发工资、拒绝办理离职手续等。
协议的约束力：如果劳动者自愿补签了保密协议，且协议内容合法、有效，那么该协议对劳动者和用人单位均具有约束力。劳动者应当遵守协议约定的保密义务，否则可能面临法律后果。
三、建议与注意事项
及时签订协议：为了避免后续可能出现的纠纷，建议用人单位在劳动者入职时就与其签订包含保密条款的劳动合同或单独的保密协议。
明确协议内容：保密协议应当明确约定保密的内容、范围、期限以及违反保密义务的法律责任等，以确保协议的合法性和有效性。
保护劳动者权益：用人单位在签订保密协议时，应当尊重劳动者的合法权益，不得通过协议侵犯劳动者的隐私权、知情权等。
综上所述，入职时未签订保密协议，离职时补签并不违反法律规定。但补签的协议应当合法、有效，且劳动者有权选择是否签订。如果劳动者认为协议内容不合理或侵犯了自己的权益，可以拒绝签订，并寻求法律援助。