关于“不签结算协议是否有效”的问题，这主要取决于具体的情境和法律规定。以下是对这一问题的详细解答：
一、结算协议的重要性与独立性
结算协议的定义：
- 结算协议是双方当事人在工程竣工后，对工程价款进行核对、确认并达成一致的书面文件。
- 它可以是建设工程施工合同中的结算条款，也可以是独立于合同的单独协议。
结算协议的重要性：
- 工程结算是合同履行的核心，也是实务中争议较多的部分。
- 结算协议是双方对工程价款的一致认可，是支付工程款的重要依据。
结算协议的独立性：
- 即使建设工程施工合同无效，只要结算协议本身内容真实、合法，且不损害他人权益，它仍然应被认定为有效。
- 结算协议的效力不受合同无效的影响。
二、不签结算协议的法律后果
无法确定工程价款：
- 如果双方未签订结算协议，工程价款将无法得到明确确认。
- 这可能导致后续支付工程款时出现纠纷。
可能影响诉讼结果：
- 在诉讼中，如果双方未对工程价款进行结算，法院可能需要通过司法鉴定来确定工程造价。
- 这将增加诉讼的复杂性和时间成本。
可能承担法律责任：
- 在某些情况下，如政府采购等，中标后拒签结算协议可能构成违约行为。
- 供应商可能因此受到罚款、列入不良行为记录名单等处罚。
三、实际案例分析
以你提供的案例为例，被告杨某作为发包方与原告刘某签订了施工合同，并在工程竣工后进行了结算，出具了欠条。尽管后来杨某以合同无效为由申请对工程造价进行鉴定，但法院认为结算协议有效，并判决杨某按照结算协议支付剩余工程款。
这个案例说明，即使合同无效，只要结算协议真实、合法，它仍然具有法律效力。
四、建议与结论
建议：
- 在工程竣工后，双方应及时进行结算并签订结算协议。
- 结算协议应明确工程价款、支付方式、支付时间等关键条款。
- 如果对结算协议有争议，应及时寻求法律途径解决。
结论：
- 不签结算协议可能导致工程价款无法确定，增加纠纷风险。
- 结算协议具有独立性，即使合同无效，它仍然可能有效。
- 因此，建议双方在工程竣工后及时签订结算协议，以明确双方权利义务。