可以私下签补充协议对人民调解协议书中的赔偿金额进行变更或补充。但需要注意以下几点：

1. 双方自愿：补充协议必须是双方自愿达成的，不能有任何欺诈、胁迫等违法情形。

2. 内容合法：补充协议的内容不能违反法律法规的强制性规定，也不能损害国家、集体或者第三人的合法权益。

3. 明确性：补充协议应当明确具体地约定变更或补充的内容，包括但不限于赔偿金额、支付方式、支付时间等，以避免后续产生新的纠纷。

4. 与原协议的关系：补充协议是对原人民调解协议书的补充或变更，因此应当与原协议保持一致性。如果补充协议与原协议存在冲突，一般以补充协议为准，但双方另有约定的除外。

5. 书面形式：为了确保双方权益，建议补充协议采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。

在实际操作中，如果双方对人民调解协议书中的赔偿金额有异议或需要变更，可以协商签订补充协议。但务必确保补充协议的合法性、有效性和明确性，以避免后续产生不必要的法律纠纷。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。