单位依据规章制度扣款，在特定条件下是合法的，但这也需要结合多方面因素进行具体分析。以下是对此问题的详细解答：
合法扣款的前提条件
规章制度的合法性：
- 制定程序合法：规章制度必须经过民主程序制定，比如通过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。
- 内容合法：规章制度的内容不能违反国家法律法规、行政法规及政策规定。
- 公示与告知：规章制度需要向全体员工公示，确保员工知晓并理解相关规定。
扣款行为的合理性：
- 员工违规：员工必须确实违反了规章制度中明确规定的条款。
- 扣款目的正当：扣款应该是为了弥补员工过错给单位造成的实际经济损失或基于合理的管理需要。
- 扣款金额限制：扣款金额不得超过员工当月工资的20%，且扣款后员工的工资不得低于当地最低工资标准。
法律依据
根据《工资支付暂行规定》第十六条，如果员工因个人原因给单位造成经济损失，单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿，但赔偿金额需符合上述法定限制。
违法扣款情形
- 规章制度不合法：如果规章制度未经民主程序制定、内容不合理或违反法律法规，或者未向员工公示，那么依据这样的规章制度进行的扣款就是违法的。
- 缺乏事实依据：如果员工没有违反规章制度，或者员工的行为并不符合规章制度中规定的扣款情形，单位却进行扣款，这也是违法的。
- 扣款金额超出法定限额：如果扣款金额超过员工当月工资的20%，或者扣款后员工工资低于当地最低工资标准，这也是违法的。
员工维权途径
面对单位的违法扣款行为，员工可以采取以下途径维护自己的权益：
- 与公司协商解决：首先尝试与公司进行沟通协商，要求公司说明扣款依据和合理性。
- 向劳动行政部门投诉：如果协商无果，可以向当地劳动行政部门投诉公司的违法扣款行为。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果对劳动行政部门的处理决定不服，可以向劳动仲裁机构申请仲裁；如果对仲裁结果仍不满意，可以依法向人民法院提起诉讼。
总结
综上所述，单位依据规章制度扣款是否合法，关键在于规章制度的合法性、扣款行为的合理性以及是否遵守了相关法律法规的规定。员工在面对单位的扣款行为时，应了解自己的合法权益，并通过合法途径进行维权。同时，单位在制定和执行规章制度时，也应严格遵守国家法律法规，确保员工的合法权益不受侵害。