发现债务纠纷调解协议书出错三年，这一情况的处理方式需根据具体错误内容及影响来确定。以下是我作为律师给出的详细分析：

1. 首先评估错误的影响：

   • 审查协议书中的错误是否对协议的核心条款或双方的权利义务产生了实质性影响。
   • 分析错误是否导致了不公平的结果，或者是否有一方因错误而遭受了重大损失。

2. 根据错误影响采取不同的措施：

   • 如果错误未对协议产生实质性影响：双方可以协商修正错误，并签署补充协议，明确修正内容，以确保协议的准确性和完整性。
   • 如果错误导致了不公平或重大损失：
     1. 尝试协商：首先，建议与对方进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。
     2. 法律途径：若协商无果，可以考虑通过法律途径解决。具体包括但不限于向法院提起诉讼，请求确认协议无效或请求撤销协议，并根据实际情况要求赔偿损失。在此过程中，需要收集充分的证据来证明错误的存在及其影响。

3. 考虑时效性问题：

   • 需要注意的是，提起诉讼或请求撤销协议可能受到法律规定的时效限制。因此，在决定采取法律途径前，务必咨询专业律师，了解相关法律规定，并确保在时效期内采取行动。

4. 保留证据，备查备用：

   • 无论采取何种方式处理，都应妥善保留与协议书错误相关的所有证据，包括原始协议书、错误证明、双方沟通记录等，以备将来可能需要使用。

综上所述，发现债务纠纷调解协议书出错三年后，应首先评估错误的影响，然后根据具体情况采取不同的措施。如需进一步的法律帮助或咨询，请直接向我提问，我将竭诚为您提供专业的法律服务。