公司委托收款函件只有复印件，一般情况下是不可以的。具体原因如下：

根据最高人民法院颁布的证据规则，仅有复印件而无原件进行核对的情况下，法院一般不会认可该复印件的法律效力。这是因为复印件容易伪造或篡改，其真实性难以保证。因此，如果公司仅持有委托收款函件的复印件，而无法提供原件进行核对，那么在法律上可能会面临证据不足的问题。

然而，也存在一些特殊情况：

1. 对方当事人认可：如果对方当事人对复印件的内容表示认可，那么该复印件在双方之间可能具有约束力。但这种情况下，仍然建议尽快获取原件以确保证据的完整性和法律效力。
2. 其他证据佐证：如果公司能够提供其他证据来佐证复印件的内容，如相关的银行转账记录、聊天记录等，那么这些证据可能能够共同构成完整的证据链，从而证明复印件的真实性。

综上所述，公司委托收款函件仅有复印件是存在法律风险的。为了确保自身权益，公司应尽可能获取并保存原件，或者在无法获取原件的情况下，通过其他证据来佐证复印件的内容。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。