员工与用人单位达成的人民调解协议，如果确实存在不公平的情况，是可以申请撤回或请求变更、撤销的。下面我详细为您解释：

法律依据

根据《中华人民共和国人民调解法》以及相关法律法规的规定，人民调解协议虽然具有法律约束力，但如果协议内容显失公平，或者存在其他法定可撤销、变更的情形，当事人是有权向人民法院申请撤销或变更该协议的。

申请撤回或变更、撤销的条件

1. 显失公平：协议内容明显对一方当事人不利，违背了公平原则。
2. 存在欺诈、胁迫等情形：如果协议是在欺诈、胁迫等不正当手段下签订的，当事人也可以申请撤销。
3. 违反法律、行政法规的强制性规定：如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，那么该协议也是无效的，可以申请撤销。

申请流程

1. 收集证据：首先，您需要收集能够证明协议显失公平或存在其他可撤销情形的证据。
2. 向人民法院提起诉讼：携带相关证据，向人民法院提起诉讼，请求撤销或变更人民调解协议。
3. 法院审理：法院会对您的申请进行审理，并根据证据和法律规定作出判决。

注意事项

1. 时效问题：申请撤销或变更人民调解协议通常需要在一定的时效期内提出，具体时效期可能因地区而异，建议您及时咨询当地法院或律师。
2. 证据充分性：证据是申请撤销或变更协议的关键，因此务必确保您收集的证据充分、有效。

如果您在申请撤回或变更、撤销人民调解协议的过程中遇到任何问题，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会为您提供专业的法律建议和支持。