公司运行期间发生工伤事故后，公司注销依然可以理赔。具体分析和建议如下：

1. 确定责任主体：

   • 工伤事故发生后，若公司随后注销，员工仍有权要求赔偿。
   • 首要任务是确定公司注销前的责任主体，如公司的股东、发起人或出资人。
   • 若这些责任主体在公司注销时明确承诺对公司债务承担偿还责任，则员工可以要求他们承担工伤赔偿义务。

2. 工伤赔偿程序：

   • 按照工伤赔偿的常规流程，员工需要先进行工伤认定。
   • 完成工伤认定后，再进行劳动能力鉴定，以确定具体的赔偿数额。
   • 赔偿项目通常包括医疗费、停工留薪期工资、伤残津贴等。

3. 主张权利的途径：

   • 员工可以通过劳动仲裁来主张自己的权利，但需要在规定的时效内提出申请，并准备相关证据，如劳动合同、工伤认定决定书、劳动能力鉴定结论等。
   • 员工也可以选择向法院提起诉讼，此时需要准备好起诉状以及相关证据材料。

4. 法律保障：

   • 只要公司注销后仍有财产可供执行，或者股东等责任主体存在需承担责任的情况，员工的工伤赔偿就有法律保障。
   • 员工可以依法维护自身的合法权益，不受公司注销的影响。

综上所述，即使公司在工伤事故发生后注销，员工依然有权要求赔偿。建议员工及时按照工伤赔偿程序进行申请，并准备好相关证据材料，以维护自身的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。