公司补偿金以微信转账的形式支付是可以的，但为了避免后续可能出现的纠纷，建议采取一些额外的措施来确保双方的权益。

首先，虽然法律并没有严格限定补偿金的支付方式，但为了确保支付的明确性和可追溯性，公司与员工之间最好签订一份书面协议。这份协议应该明确补偿金的金额、支付方式（在这里是微信转账）、以及双方的权利和义务等关键内容。这样，一旦出现争议，这份协议就可以作为有力的证据来支持双方的约定。

其次，在进行微信转账时，务必在转账备注中清楚地注明款项的性质，比如“辞退补偿金”。这样做可以帮助双方明确这笔转账的用途和性质，避免未来产生误解或纠纷。同时，保留好微信聊天记录和转账记录也是非常重要的，这些记录可以作为支付凭证，在需要时提供证明。

当然，虽然微信转账是一种便捷的支付方式，但考虑到其作为证据的证明力相对较弱，以及可能存在的其他风险（如微信账户被盗用等），如果条件允许的话，选择银行转账等更具公信力的支付方式也是一个不错的选择。银行转账可以留下更为清晰和可查的财务记录，对于双方来说都更加安全可靠。

总之，公司补偿金以微信转账的形式支付是可行的，但为了确保双方的权益和安全，建议采取签订书面协议、注明款项性质并保留凭证等措施来降低潜在的风险。