指令继续审理的案件，原来证据及庭审调查仍然有效。下面我将从法律角度和实际操作两个方面进行详细解释：
法律角度
证据的有效性：
- 在刑事诉讼中，证据是认定案件事实的依据。一旦证据在庭审中被提交并经过质证，其有效性不会因为案件的暂停或继续审理而受到影响。
- 根据《刑事诉讼法》的相关规定，证据应当具有合法性、客观性和关联性。只要证据符合这三个条件，并且在庭审中被正确提交和质证，那么无论案件是否继续审理，这些证据都是有效的。
庭审调查的有效性：
- 庭审调查是法院为了查明案件事实而进行的询问、质证、辩论等诉讼活动。这些活动在案件审理过程中具有法律效力。
- 即使案件因为某种原因被暂停，后来又被指令继续审理，之前已经进行的庭审调查仍然有效，不需要重新进行。
实际操作
证据的使用：
- 在案件继续审理时，之前提交的证据仍然可以作为认定案件事实的依据。法院会根据这些证据以及新提交的证据来综合判断案件事实。
- 如果之前提交的证据存在瑕疵或不足，当事人可以在继续审理的过程中进行补充或解释。
庭审调查的继续：
- 在案件继续审理时，法院会根据之前的庭审记录，继续对案件进行审理。如果需要，法院还可以组织新的庭审调查，以进一步查明案件事实。
- 当事人可以在继续审理的过程中，对之前未充分阐述的观点进行补充，或者对新的证据进行质证和辩论。
综上所述，指令继续审理的案件，原来证据及庭审调查仍然有效。这是由法律的规定和诉讼活动的性质所决定的。在案件继续审理时，法院会根据之前的证据和庭审调查，以及新提交的证据和诉讼活动，来综合判断案件事实并作出裁决。如果你对此类问题还有疑问，或者需要更具体的法律帮助，请直接向我咨询。