当您遇到合同公司与发票公司不一致，且您作为当事人对此并不知情的情况时，这确实是一个需要谨慎处理的问题。以下是我为您提供的详细、有深度的解答和建议：
一、立即核实与沟通
核实不一致的原因：
- 可能是单位名称的变更、代理关系、误填发票或合同，或是其他特殊情况导致的。了解具体原因对于后续决策至关重要。
及时与合同对方沟通：
- 尽快与合同对方取得联系，明确说明发票单位与合同单位不一致的情况，并寻求解决方案。
- 要求对方提供书面说明或授权文件，以证明发票单位的合法性及其与合同公司的关系。
二、评估法律风险与税务合规性
法律风险：
- 根据《中华人民共和国民法典》，当事人应全面履行合同义务。若合同中明确约定了开票公司，而实际开票公司与签约公司不一致，可能构成违约。
- 您有权要求违约方承担责任，并寻求法律救济。
税务风险：
- 税务机关要求发票与实际交易相符。不一致可能导致税务检查，甚至涉嫌虚开发票，违反《中华人民共和国发票管理办法》。
- 这可能引发税务处罚，包括补缴税款、滞纳金，甚至刑事责任。
三、采取应对措施
存在委托代理关系：
- 如果合同公司与发票公司之间存在委托代理关系，应确认该关系的有效性，并要求提供委托代理协议等证明材料。
- 仔细审查协议的真实性和合法性，确保其符合相关法律法规的要求。
第三方债务加入或转移：
- 如开票公司自愿加入债务关系，需三方（合同公司、开票公司、您）共同签订书面协议，明确各自的责任和义务。
- 如为债务转移，需经您作为债权人同意，并签订债务转移协议。
要求更正与出具法律文书：
- 若不一致可能导致法律风险或税务问题，应要求对方更正发票单位或合同单位。
- 在特定情况下，可由签约公司出具法律文书，指定开票公司代收款项，并明确收款账号和开户银行。
法律途径：
- 如果协商无果，您可根据相关法律法规向法院提起诉讼或申请仲裁，要求对方提供正确的发票或赔偿损失。
四、财务处理与证据保留
财务处理：
- 在等待问题解决期间，应妥善进行财务处理，将发票和合同单独归档，并注明不一致情况。
- 避免因处理不当而导致的财务混乱或税务风险。
保留证据：
- 保留所有与发票、合同相关的文件、沟通记录、电子邮件等证据。
- 这些证据在日后可能出现的纠纷或法律诉讼中将起到至关重要的作用。
综上所述，当您遇到合同公司与发票公司不一致且不知情的情况时，应立即核实原因、与合同对方沟通、评估法律风险与税务合规性，并采取相应的应对措施。同时，务必妥善进行财务处理并保留好所有相关证据，以维护自身的合法权益。