机关事业单位旷工一般不可以扣绩效。绩效奖金是根据劳动者的绩效任务来确定的，如果劳动者完成了绩效任务，用人单位不能因其旷工而扣除其绩效奖金。对于劳动者应得的工资，单位应当足额进行支付。
分析说明：
- 绩效奖金的性质：绩效奖金是劳动者基于其工作绩效而获得的奖励，它不同于基本工资，不是劳动者必然获得的报酬部分。因此，对于绩效奖金的扣除，需要更加谨慎地考虑其合法性和合理性。
- 旷工与绩效奖金的关系：旷工是劳动者违反劳动纪律的行为，单位可以依据相关规章制度对旷工行为进行处罚，如扣除基本工资等。但是，如果劳动者已经完成了绩效任务，那么单位就不能以旷工为由扣除其绩效奖金。因为绩效奖金是对劳动者工作绩效的奖励，与旷工行为本身没有直接关联。
- 单位规章制度的规定：虽然单位有权制定自己的规章制度，并在规章制度中规定对旷工行为的处罚措施，但这些规定必须符合法律法规的规定。如果单位规章制度中规定因旷工可以扣除绩效奖金，但这一规定与法律法规相抵触，那么这一规定就是无效的。
法律建议：
- 对于机关事业单位来说，在制定规章制度时，应明确区分基本工资和绩效奖金的性质和扣除条件，确保规章制度的合法性和合理性。
- 在处理旷工问题时，应严格按照规章制度执行，并确保处罚措施的合法性和公正性。
- 如果劳动者对单位扣除绩效奖金的行为有异议，可以通过法律途径维护自己的合法权益。
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