以身体体检原因拒绝新员工入职，在大多数情况下是不合法的。下面我将从法律角度详细解释这一结论：

1. 违反平等就业原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《就业促进法》，用人单位在招聘过程中应当遵循平等就业的原则，不得因劳动者的性别、年龄、身体状况等因素而歧视劳动者。
   • 体检结果虽然可以作为评估劳动者是否适合特定工作岗位的参考，但不能作为拒绝录用的唯一或主要理由，除非该岗位确实对劳动者的身体状况有特定要求，且这种要求是基于工作性质和安全考虑的合理且必要的要求。

2. 可能构成就业歧视：

   • 如果用人单位仅仅因为体检结果中的某些非关键性指标（如轻微的健康问题或不影响工作能力的身体状况）就拒绝录用劳动者，这可能构成对劳动者的就业歧视。
   • 劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起民事诉讼，要求用人单位承担相应的法律责任。

3. 特殊情况的考量：

   • 当然，也存在一些特殊情况，如某些特定工作岗位确实对劳动者的身体状况有严格要求（如食品行业、医疗行业等），在这种情况下，用人单位可以基于合理的健康和安全考虑，对劳动者的身体状况进行更为严格的评估。
   • 但即使在这种情况下，用人单位也应当遵循相关法律法规的规定，确保评估过程的公正性和合理性，并避免对劳动者进行不必要的歧视。

综上所述，以身体体检原因拒绝新员工入职在大多数情况下是不合法的，除非该拒绝是基于工作性质和安全考虑的合理且必要的要求。如果你在这方面遇到了问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。