即使工资不是公司直接发放的，也可能存在劳动关系。劳动关系的认定并不仅仅取决于工资的发放主体，而是需要综合多方面因素进行考量。以下是对这一问题的详细分析：

1. 劳动关系的认定因素：

   • 用人单位和劳动者是否符合法律、法规规定的主体资格。
   • 劳动者是否受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动。
   • 劳动者提供的劳动是否是用人单位业务的组成部分。

2. 工资发放与劳动关系：

   • 工资发放主体并非判定劳动关系的唯一依据。即便工资不是由公司直接发放，例如存在劳务派遣等情况，劳动者与派遣单位签订劳动合同，但其工作由用工单位安排，工资可能由派遣单位或用工单位支付，此时依然可能存在劳动关系。
   • 在某些特殊情况下，如劳务派遣、外包等，工资可能由第三方支付，但这并不影响劳动者与用工单位之间劳动关系的存在。

3. 实际用工情况的审查：

   • 要准确判断劳动关系是否成立，需全面审查双方之间的实际用工情况等相关事实。这包括劳动合同、工作证、考勤记录、工作内容、工作地点、工作时间等多方面因素。

综上所述，工资的支付主体并不能直接决定是否存在劳动关系。即使工资不是由公司直接发放，只要满足劳动关系的认定条件，如双方符合主体资格、劳动者受用人单位管理、从事用人单位安排的有报酬的劳动等，就可能存在劳动关系。因此，在判断劳动关系时，应综合考虑多方面因素，而非仅依据工资发放主体这一单一因素。如果您对此类问题有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。