当劳动者的月工资高于所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍时，经济补偿金的计算确实遵循一套特殊的标准。以下是对这一计算标准的详细解释：

一、法律依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的相关规定，对于月工资高于社平工资三倍的劳动者，其经济补偿金的计算有明确的特殊规定。这一规定旨在平衡用人单位与劳动者之间的利益关系，确保经济补偿金的合理性和公平性。

二、计算基数

1. 月工资定义：这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
2. 上限设定：若劳动者的月工资高于当地上年度职工月平均工资的三倍，经济补偿金将按照职工月平均工资三倍的数额作为计算基数。例如，若某地区上年度职工月平均工资为5000元，则三倍为15000元，这将作为计算经济补偿的月工资上限。

三、支付年限

1. 最高限额：对于工资高于社平工资三倍的劳动者，经济补偿金的支付年限最高不超过十二年。
2. 具体计算：经济补偿金按照劳动者在本单位工作的年限来计算，具体为：每满一年支付一个月工资的经济补偿；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。但总年限不得超过十二年。

四、计算公式

经济补偿金的具体计算方式为：当地上年度职工月平均工资×3×补偿年限（不超过12年）。例如，若某地区上年度职工月平均工资的三倍为15000元，劳动者在用人单位工作了10年，那么其应得的经济补偿金为15000×10=150000元。

五、注意事项

1. 不影响其他权益：这一经济补偿金的计算规定仅适用于经济补偿金的计算，不影响劳动者依法享有的其他合法权益。
2. 数据准确性：在实际计算过程中，需要准确确定当地上年度职工月平均工资，并据此计算经济补偿金。
3. 争议解决：如果劳动者对经济补偿金的计算有异议，可以通过与用人单位协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等合法途径来解决争议。

综上所述，对于工资高于社平工资三倍的劳动者，其经济补偿金的计算受到严格的法律规定限制，包括计算基数和支付年限的双重限制。这是为了保障劳动者的合法权益，同时避免用人单位承担过重的经济负担。希望这一解释能帮助您更好地理解相关法律规定和计算标准。