工伤认定申请可以由以下主体直接提出：

1. 用人单位：

   • 工伤保险遵循雇主责任原则，因此职工所在用人单位承担首要的工伤申报义务。
   • 用人单位应在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 如遇特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。

2. 工伤职工或者其近亲属：

   • 当用人单位未按规定提出工伤认定申请时，工伤职工或者其近亲属可以在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 特别是当受伤职工在医疗机构接受治疗、难以亲自办理时，其近亲属（如配偶、父母、成年子女等）可以成为工伤认定申请的主体。

3. 工会组织：

   • 工伤职工所在用人单位的工会组织同样有权在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

综上所述，工伤认定的申请可以由用人单位、工伤职工或者其近亲属、以及工伤职工所在用人单位的工会组织直接提出。在提出申请时，应确保按照规定的时限和要求向统筹地区社会保险行政部门提交相关材料。