电子合同甲方只盖了章而法定代表人没签字，通常情况下合同是有效的。下面我为您详细解释：

1. 一般规定：

   • 根据《民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同时，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这意味着盖章、签字、按指印这三种方式具有同等的法律效力，并不要求三者同时出现。只要合同上的盖章是真实有效的，且不存在其他导致合同无效的情况（如违反法律法规的强制性规定、违背公序良俗等），合同即成立并生效。

2. 特殊情况：

   • 如果合同中明确约定了“必须签字且盖章合同才生效”，那么仅有盖章而法定代表人未签字的情况下，合同可能不生效。此时，合同的效力取决于双方的具体约定。
   • 另外，如果能证明盖章行为并非企业的真实意愿，如存在盗盖、抢盖公章等情况，合同的效力也可能存在问题。

3. 实际案例：

   • 以A公司与B公司签订合同为例，A公司在合同上加盖了公章但法人未签字。若合同无其他导致无效的情形，A公司盖章后合同应成立并生效。但若合同中有明确约定必须签字且盖章才生效，那么A公司仅盖章而未签字，合同则可能不生效。

综上所述，电子合同甲方只盖了章而法定代表人没签字，在一般情况下合同是有效的。但具体效力还需结合合同的具体约定以及相关法律规定来进行综合考量。如果您在合同签订或履行过程中遇到任何问题，欢迎随时向我咨询。