证书聘用协议是否合法，取决于协议的具体内容和签订协议的具体情境。下面我从几个方面来详细分析：

1. 协议内容的合法性：

   • 证书聘用协议，如果是指雇主与雇员之间就特定证书（如职业资格证书、技能证书等）的持有和使用而签订的协议，其内容必须遵守国家法律法规，不得违反强制性规定。
   • 协议中应明确双方的权利义务，包括证书的提供、使用范围、期限、费用、违约责任等，以确保协议的合法性和有效性。

2. 签订协议的主体资格：

   • 签订证书聘用协议的双方必须具备相应的主体资格。雇主应是合法注册的企业或组织，雇员应是具备完全民事行为能力的自然人。
   • 如果雇员是未成年人或限制民事行为能力人，其签订协议需经过法定代理人的同意或追认。

3. 协议与劳动关系的关联性：

   • 如果证书聘用协议是作为劳动合同的一部分或补充，那么它应与劳动合同保持一致，不得与劳动合同中的条款相冲突。
   • 如果协议是独立的，那么它应明确与劳动关系的关联程度，例如是否作为聘用条件、是否影响薪资待遇等。

4. 证书的合法性与有效性：

   • 协议中涉及的证书必须是合法取得的，且在有效期内。如果证书是伪造的或已过有效期，那么协议可能因违法或无效而失去法律效力。

5. 特殊行业的规定：

   • 对于某些特殊行业（如医疗、建筑、金融等），国家可能有特定的法律法规对证书的持有和使用进行规定。在这些行业中，证书聘用协议还需遵守这些特殊规定。

综上所述，证书聘用协议在符合上述条件的情况下是合法的。但具体是否合法，还需根据协议的具体内容和签订协议的具体情境来判断。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。