停职发基础工资是否合法，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 合法情况：

   • 协商一致：如果用人单位与劳动者经过平等协商，就停职发基础工资达成一致意见，且不违反法律法规的强制性规定，那么这种行为是合法的。
   • 法定情形：在某些法定情形下，如企业因不可抗力因素或政府行政命令导致停工，或者企业经营严重困难且经过法定程序后，可以对员工进行停工放假，并按规定支付工资或生活费。这种情况下，停职发基础工资也是合法的。
   • 工伤停工留薪期：特别需要注意的是，对于因工作遭受事故伤害或患职业病的职工，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”是一个综合性的概念，包括了基本工资、奖金、津贴等各项福利。因此，在工伤停工留薪期内，仅发基础工资是不合法的。

2. 不合法情况：

   • 未经协商单方决定：如果用人单位未经与劳动者协商，擅自单方面决定停职发基础工资，这侵犯了员工的合法权益，属于违法行为。
   • 以停职发基础工资逼迫员工离职：用人单位为避免支付经济补偿金等费用，采用停职发基础工资的方式逼迫员工主动离职，这也明显违反法律规定。

3. 劳动者权益保护：

   • 如果用人单位未按照劳动合同约定提供劳动条件或未及时足额支付劳动报酬（包括停职期间应发的工资或生活费），劳动者可以解除劳动合同并要求支付经济补偿金。
   • 劳动者与用人单位因停职发基础工资发生争议时，可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决。

综上所述，停职发基础工资是否合法取决于具体情况及法律法规的规定。在未经协商或违反法律法规的情况下，用人单位擅自决定停职发基础工资是违法的。劳动者应了解自己的权益，并在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。