如果因配合调查被拘留，公司不发工资，这需要根据具体情况来分析。
首先，我们要明确的是，依照相关法规，受刑事拘留之约束期间，员工无法正常出勤工作，因此所在单位也无法发放本应属于该员工的薪酬待遇。这是因为，在员工所受人身自由限制期限内，用人单位有权利与其暂时中止执行劳动合同约定的执行。在此期间，用人单位无需履行劳动合同中的相关职责和义务。
然而，如果经过验证，用人单位对员工进行了错误的人身自由限制，那么员工在暂时中止履行劳动合同时所产生的经济损失，有权依据我国《中华人民共和国国家赔偿法》的相关规定，要求相关部门给予赔偿补偿。
另一方面，如果是公司因为其他原因（如认为员工涉嫌违法但并未被正式拘留）而擅自停发工资，那么这是不合法的。薪酬福利应当按照劳动合同约定的时间周期逐月发放至每位劳动者手中，任何情况下，企业均不得擅自拖延、扣除或无故拖欠。
因此，具体处理方式如下：
确认拘留性质：首先确认自己是因何种原因被拘留，以及这种拘留是否属于法律意义上的“刑事拘留”。如果是刑事拘留，那么公司不发工资是合理的；如果不是，或者公司存在误解，那么公司应当继续支付工资。
与公司沟通：如果认为公司停发工资是不合理的，可以尝试与公司进行沟通，解释清楚自己的情况，并要求公司恢复工资发放。
申请劳动仲裁或提起诉讼：如果沟通无果，可以选择向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，要求公司支付拖欠的工资及可能的赔偿金。
寻求法律援助：在整个过程中，如果遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业律师的法律援助，以确保自己的权益得到妥善维护。
总之，因配合调查被拘留而公司不发工资的情况需要根据具体情况来分析。如果是合法的刑事拘留，公司不发工资是合理的；如果不是，或者公司存在误解或擅自停发工资，那么员工有权要求公司继续支付工资，并可以通过法律途径来维护自己的权益。