当单位不承认劳动关系，而您需要进行劳动能力鉴定时，可以按照以下步骤操作：

一、确认劳动关系

首先，必须确认与单位之间的劳动关系，这是进行劳动能力鉴定的前提。您可以通过以下方式确认劳动关系：

1. 搜集证据：

   • 工资支付凭证：如银行流水、工资条等，能直观反映劳动关系中的经济往来。
   • 工作证：能证明您在该单位的工作身份。
   • 考勤记录：显示您上班的时间和出勤情况。
   • 同事证人证言：同事的证词也可以作为辅助证据。
   • 其他相关证据：如招聘记录、工作邮件、通话记录等。

2. 提起劳动仲裁：

   • 如果单位否认劳动关系，您可以向当地的劳动争议仲裁机构提起仲裁，请求确认劳动关系。
   • 在仲裁过程中，您需要提交上述搜集的证据，以证明您与单位之间存在劳动关系。
   • 仲裁裁决如果认定存在劳动关系，那么您就可以进行下一步的劳动能力鉴定。

3. 提起诉讼：

   • 如果对仲裁裁决结果不满意，您可以在规定期限内向人民法院提起诉讼。
   • 在诉讼过程中，法院会依据双方所提供的证据以及相关法律规定进行细致的审理和公正的判决。

二、申请劳动能力鉴定

在确认劳动关系后，您可以按照以下步骤申请劳动能力鉴定：

1. 准备材料：

   • 工伤认定申请表（如果适用）。
   • 劳动关系证明材料（如劳动仲裁裁决书或法院判决书）。
   • 医疗诊断证明：包括医院出具的诊断书、病历、检查报告等。
   • 其他可能需要的材料，如身份证、照片等。

2. 提交申请：

   • 将准备好的材料提交给当地的社会保险行政部门或指定的劳动能力鉴定机构。
   • 提交申请时，请确保所有材料齐全，并按照要求填写申请表。

3. 等待鉴定：

   • 鉴定机构在收到申请后，会安排专家对您的劳动能力进行评估。
   • 您需要按照鉴定机构的要求配合进行鉴定，如接受面试、体检等。

4. 获取鉴定结果：

   • 鉴定完成后，鉴定机构会出具劳动能力鉴定结论书。
   • 您可以根据鉴定结果采取相应的措施，如申请工伤赔偿等。

综上所述，当单位不承认劳动关系时，您需要先通过合法的途径确认劳动关系，然后再进行劳动能力鉴定。在整个过程中，请务必保留好所有相关证据，并积极配合相关部门的工作。