当您在工作中遭到他人殴打时，为了维护自身的合法权益，您可以按照以下步骤进行处理：

一、确保安全与及时报警

1. 首要任务是保护自己：如果暴力行为仍在进行，您应尽快脱离危险环境，并大声呼救或寻找机会逃至安全区域。
2. 记录关键信息：在确保自身安全的前提下，尽量记住并记录下攻击者的体貌特征、衣着、行为特点以及逃跑方向等信息，这有助于警方后续的调查和抓捕。
3. 立即拨打报警电话：拨打当地的紧急电话（如110），详细报告事件的时间、地点、涉及人员以及您的伤情等，并积极配合警方的调查，提供证言和证据。

二、寻求医疗救助并保留证据

1. 及时就医：无论您的伤势轻重，都应尽快前往正规医疗机构进行诊治，并详细告知医生受伤的具体经过。
2. 妥善保留医疗材料：所有与医疗相关的文件，如病历、诊断证明、检查报告、医疗费用清单及缴费凭证等，都应妥善保管，这些将是后续主张赔偿的重要依据。
3. 收集其他相关证据：如果可能，尝试获取现场监控录像，寻找目击者并记录其联系方式和证词，同时拍照或录像记录您的伤势和现场情况。

三、通知雇主与工伤认定申请

1. 及时告知雇主：向您的雇主报告事件，以便其了解情况并提供必要的支持，同时了解工伤保险的缴纳情况。
2. 申请工伤认定：如果您的伤势符合《工伤保险条例》的规定，即在工作时间和工作场所内因履行工作职责受到暴力伤害，您应要求单位或自行向社会保险行政部门提出工伤认定申请。

四、明确责任与协商索赔

1. 侵权责任认定：打人者的行为已构成侵权，根据《民法典》的规定，其应承担相应的赔偿责任，包括医疗费、护理费、误工费等。
2. 与打人者协商：在警方的调解下，尝试与打人者及其家属协商赔偿事宜，明确您的诉求和期望的赔偿金额。
3. 与用人单位协商：若您的伤势被认定为工伤，与用人单位协商工伤赔偿事宜，了解工伤保险待遇标准及支付方式。

五、法律途径解决与咨询专业律师

1. 提起民事诉讼：如果协商无果，您可以向人民法院提起民事诉讼，通过法律途径来维护您的权益，并提供充分的证据来支持您的主张。
2. 提起刑事诉讼附带民事诉讼：如果打人者的行为构成犯罪，您可以在刑事诉讼过程中提起附带民事诉讼，要求赔偿物质损失。
3. 咨询专业律师：考虑咨询专业律师，以了解您的法律权益和赔偿途径。律师可以帮助您准备法律文件，并指导您如何起诉或索赔。

六、跟进处理与关注身心健康

1. 保持与警方的联系：了解案件的进展，并配合律师进行法律程序。
2. 关注身心健康：在整个过程中，务必关注自己的身心健康。如果感到心理压力或情绪问题，及时寻求心理咨询或治疗。

综上所述，当您在工作中遭到他人殴打时，应确保自身安全、及时报警、寻求医疗救助并保留证据。同时，通知雇主并申请工伤认定，明确责任后与打人者和用人单位协商索赔。如果协商无果，则通过法律途径解决，并咨询专业律师以获取帮助。在整个过程中，请保持冷静和理智，并密切关注自己的身心健康。