结论前置：购房人以房屋为在建工程抵押为由要求解除认购协议，这一要求并不一定合理，具体需根据协议内容及实际情况来判断。
分析说明：
协议约定：首先，要看认购协议中是否有关于房屋抵押的特别约定。如果协议中明确规定了房屋存在抵押情况，并且购房人在签署时已经知晓并接受这一条件，那么购房人后续以此为由要求解除协议可能并不合理，因为这意味着购房人已经对房屋抵押的情况表示了同意。
抵押权与合同效力：根据我国《民法典》的相关规定，抵押期间，抵押人可以转让抵押财产，但应当及时通知抵押权人。这意味着，即使房屋存在抵押，也并不影响其转让，只要转让时通知了抵押权人。因此，从法律层面来说，房屋的在建工程抵押状态并不直接导致认购协议无效或可解除。
购房人权益：当然，如果购房人在签署认购协议时并不知晓房屋存在抵押情况，或者协议中并未明确提及，而后续发现房屋存在抵押，这可能构成对购房人的欺诈或隐瞒。在这种情况下，购房人有权要求解除协议，并可能要求赔偿损失。
特殊情况：另外，如果抵押权的存在严重影响了购房人实现合同目的，比如导致房屋无法过户或存在被强制执行的风险，那么购房人也有权基于合同目的无法实现而要求解除协议。
总结：综上所述，购房人以房屋为在建工程抵押为由要求解除认购协议是否合理，需要具体看认购协议的约定、购房人签署时的知情情况、抵押权对合同实现的影响等多个因素。如果购房人认为自己的权益受到了侵害，建议及时咨询专业律师，以便更准确地了解自己的法律地位和维权途径。