对方承认虚开发票，并不意味着自己公司一定会由经侦介入，但存在这种可能性。具体分析如下：

一. 虚开发票的法律后果

1. 虚开发票的行为违法：根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，任何单位和个人不得有下列虚开发票行为，包括为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票等。虚开发票是违法行为，可能面临法律制裁。
2. 可能涉及的刑事责任：如果虚开发票的行为构成犯罪，如逃税罪等，那么根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能会由公安机关经侦部门介入调查。

二. 经侦介入的条件

1. 案件性质：经侦部门主要负责经济犯罪的侦查，如虚开发票行为涉嫌经济犯罪，且达到一定的立案标准，经侦部门有可能会介入。
2. 举报或发现：如果有人举报或者相关部门在检查中发现存在虚开发票的行为，且认为有必要进行进一步调查，也可能会引发经侦部门的介入。

三. 自己公司的应对策略

1. 自查自纠：发现自己公司存在虚开发票的行为后，应立即进行自查自纠，停止违法行为，并主动向税务部门报告，配合调查。
2. 法律咨询：建议尽快咨询专业律师，了解具体的法律风险和应对策略，以便更好地维护公司的合法权益。

综上所述，对方承认虚开发票，并不直接决定自己公司是否会由经侦介入。这取决于虚开发票行为的性质、情节以及是否构成经济犯罪等多个因素。我建议公司应积极配合相关部门的调查，并尽快采取补救措施，以降低法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。