下达转业命令后又下达退休命令，应根据具体情况和相关法律法规来确定如何处理。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 分析转业命令与退休命令的法律效力

1. 转业命令：通常针对军人，意味着从军事岗位转向其他职业岗位。这一命令一旦下达，通常具有一定的法律约束力，需要按照命令执行。
2. 退休命令：意味着员工或军人达到退休年龄或条件，应退出工作岗位并享受退休待遇。退休命令同样具有法律效力，且通常与个人的劳动权益、社会保障等紧密相关。

二. 考虑命令下达的先后顺序及执行情况

1. 若转业命令先下达并执行：员工或军人已按照转业命令完成了职业转换，此时再下达退休命令，可能需要根据新的职业身份和退休政策来确定具体的退休时间和待遇。
2. 若退休命令先下达但未执行，随后下达转业命令：这种情况下，可能需要优先考虑退休命令的执行，因为退休是员工或军人的法定权益，且通常与年龄或工作年限紧密相关。然而，转业命令的执行也可能对退休产生一定影响，如退休待遇的计算等。
3. 命令下达时间接近，且均未执行：这种情况下，可能需要综合考虑两个命令的具体内容和执行要求，以及员工或军人的个人意愿和实际情况，来确定最优的执行方案。

三. 结合相关法律法规进行处理

1. 参考劳动法、军事法规等相关规定：在处理转业命令与退休命令的冲突时，应首先参考相关的法律法规，如《中华人民共和国劳动法》、《中国人民解放军现役军官法》等，以明确各自的权利和义务。
2. 咨询相关部门或机构：如遇到复杂的法律或政策问题，建议咨询相关部门或机构，如人力资源和社会保障部门、军事机关等，以获取更具体的指导和帮助。

综上所述，处理转业命令与退休命令的冲突时，应根据具体情况和相关法律法规来确定最优的执行方案。我建议首先明确两个命令的法律效力和执行情况，然后结合相关法律法规和实际情况进行综合考量。如有进一步需要，您可以继续咨询我。