公司仅以考勤制度为由辞退员工，员工可以通过劳动仲裁维护自身权益。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一. 考勤制度是否能作为辞退的合法依据

1. 考勤制度的合法性：首先，公司需要证明其考勤制度的合法性，即该制度是否经过民主程序制定，是否向员工公示或告知。若考勤制度本身不合法，则不能作为辞退的依据。- 例如，如果公司从未向员工公示过考勤制度，或者考勤制度的内容违反法律法规，那么该制度就不能作为辞退员工的合法理由。
2. 考勤记录的真实性：公司还需提供准确的考勤记录来证明员工违反了考勤制度。若考勤记录存在错误或争议，员工有权要求核对并纠正。
3. 辞退的合理性：即便考勤制度合法且考勤记录真实，公司还需证明辞退决定的合理性。例如，员工偶尔的迟到或早退是否足以构成严重违反公司规章制度，以至于需要辞退。

二. 员工如何应对

1. 收集证据：员工应收集与公司考勤制度、考勤记录以及辞退决定相关的所有证据，包括但不限于公司规章制度、考勤记录截图、辞退通知书等。
2. 提出异议：在收到辞退通知书后，员工应及时向公司提出异议，指出考勤制度或辞退决定存在的问题，并要求公司给出合理解释。
3. 申请劳动仲裁：若公司未能给出合理解释或拒绝更正错误，员工可以向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求撤销辞退决定或支付经济补偿金。

三. 法律依据

• 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：（二）严重违反用人单位的规章制度的。但如前所述，公司需证明考勤制度的合法性、考勤记录的真实性以及辞退决定的合理性。
• 同时，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，员工有权就劳动争议向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。

我建议，在应对此类问题时，员工应保持冷静，积极收集证据，并依法维护自身权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。