员工打电话发短信超5小时不回，首先应当确认员工的安全与健康状况，随后根据公司的规章制度进行相应处理。以下是对此问题的详细分析：

一. 确认员工的安全与健康

1. 及时联系：员工长时间不回电话或短信可能意味着出现了某种紧急情况，如健康问题、安全事故等。因此，首先应尝试通过其他方式（如联系紧急联系人、前往员工家中或工作场所等）确认员工的安全状况。

2. 关注员工福祉：一旦确认员工安全无虞，应进一步了解员工是否遇到了个人问题或困难，需要提供哪些帮助或支持。

• 例如，员工可能因家庭纠纷、健康问题等私人原因而无法及时回复。

二. 根据公司规章制度处理

1. 查看公司规定：确认公司是否有关于员工通讯回应时间的明确规定，以及员工长时间不回应可能面临的后果。

2. 按照程序处理：

   • 如果公司有明确规定，且员工的行为确实违反了规定，应按照既定程序进行处理，如给予警告、扣罚工资等。
   • 如果公司没有相关规定，或者员工的行为并未违反公司规定，则不应随意对员工进行处罚。

3. 沟通与教育：无论是否对员工进行处罚，都应与员工进行坦诚的沟通，了解其行为背后的原因，并对其进行必要的教育和引导，以避免类似情况再次发生。

三. 法律层面考虑

1. 劳动法保护：根据《中华人民共和国劳动法》，员工享有休息和休假的权利。如果员工在非工作时间或休息时间内未及时回复电话或短信，且并未对公司造成实际损失或影响，公司无权因此对员工进行处罚。

2. 避免侵犯隐私：公司在处理员工通讯问题时，应尊重员工的隐私权，不得非法获取或泄露员工的私人通讯信息。

我建议：在处理此类问题时，公司应秉持人性化和合法化的原则，既要关注员工的安全与健康，又要遵守相关法律法规和公司规章制度。如有进一步需要，您可以继续咨询我。