小公司要求员工自主清洁，这一做法并不完全合理。下面我从法律角度为您详细分析：

1. 劳动合同约定：员工与公司之间的权利义务关系主要依据劳动合同来确定。如果劳动合同中明确规定了员工需要承担清洁工作，那么公司要求员工自主清洁就是合理的。然而，在大多数情况下，劳动合同中并不会包含这样的条款。因此，如果劳动合同中没有相关规定，公司要求员工自主清洁就可能缺乏法律依据。

2. 工作职责范围：员工的工作职责通常与其岗位和职位相关。对于非保洁岗位的员工来说，清洁工作并不属于其正常的工作职责范围。公司要求员工超出其工作职责范围进行清洁工作，可能会构成对员工的不合理要求。

3. 协商一致原则：根据劳动法的相关规定，对于员工工作职责以外的工作，公司应当与员工进行协商一致。如果公司要求员工自主清洁，应当与员工进行充分沟通，并征得员工的同意。如果员工不同意，公司不能单方面强制要求员工承担清洁工作。

4. 员工权益保护：员工有权拒绝公司提出的不合理要求，包括超出工作职责范围的清洁工作。如果公司因此而对员工进行处罚或解雇，员工可以依法维护自己的权益，包括向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等。

综上所述，小公司要求员工自主清洁并不完全合理，除非劳动合同中有明确规定或者公司与员工进行了协商一致。如果员工对此有异议，可以与公司进行沟通协商，或者依法维护自己的权益。如果你在这方面遇到了具体问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律建议。