单位收取员工各种证书的做法是不合法的，员工有权拒绝，并可以向相关部门投诉举报。以下是对这一问题的详细解答：
一、法律法规依据
《中华人民共和国劳动合同法》：
- 第八十四条规定，用人单位违反本法规定，扣押劳动者居民身份证等证件的，由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人，并依照有关法律规定给予处罚。
- 这意味着，单位无权扣押员工的任何证件，包括身份证、毕业证、学位证等。
《中华人民共和国就业促进法》：
- 也有相关规定，禁止职业中介机构或用人单位扣押劳动者证件。
二、员工应对措施
拒绝交证：
- 如果单位要求收取你的证件，你有权拒绝，并明确告知单位这是不合法的。
要求退还：
- 如果你的证件已经被单位收取，你应要求单位立即退还。如果单位拒绝退还，你可以向劳动行政部门投诉。
投诉举报：
- 你可以向当地的劳动行政部门（如人力资源和社会保障局）投诉举报单位的违法行为。投诉时，请提供尽可能详细的证据，如聊天记录、邮件、收据等。
法律维权：
- 如果因为单位的违法行为给你造成了损害，你还可以依法向法院提起诉讼，要求单位承担赔偿责任。
三、注意事项
保护个人信息：
- 在任何情况下，都要注意保护自己的个人信息和证件安全。不要轻易将证件交给不熟悉的单位或个人。
留存证据：
- 与单位沟通时，尽量通过书面或电子方式留存证据，以便在需要时提供证明。
及时咨询：
- 如果你对单位的做法有疑问或不确定如何处理，可以及时咨询律师或相关机构，以获取专业的法律建议。
综上所述，单位收取员工各种证书的做法是不合法的。员工应明确拒绝这一要求，并在必要时向相关部门投诉举报以维护自己的合法权益。