农村自建房承包合同的撰写并没有严格规定必须由甲方或乙方来完成。通常，这份合同可以由双方共同协商并确定内容，然后由其中一方（甲方或乙方）起草，最后由双方共同审核并签字确认。
在实际操作中，合同的起草方可能会根据具体情况而有所不同。例如，如果甲方对建房的具体要求和细节有更清晰的了解，那么甲方可能会主动起草合同，以确保合同内容符合其期望和要求。同样，如果乙方在建筑施工方面有更专业的知识和经验，那么乙方也可能会承担起草合同的任务，以确保合同内容符合建筑行业的规范和标准。
无论是由甲方还是乙方起草合同，以下几点都是必须注意的：
合同内容要详尽：合同应明确双方的权利和义务，包括施工范围、质量要求、完工时间、付款方法、违约责任等关键条款。
条款要清晰明确：合同中的每一项条款都应该清晰明确，避免使用模糊或含糊不清的表述，以防止后续产生争议。
双方要平等协商：合同的签订应基于双方平等协商的基础上，任何一方都不得利用优势地位强迫对方接受不公平的条款。
符合法律法规：合同内容应符合国家相关法律法规的规定，确保合同的合法性和有效性。
在起草和审核合同时，双方都可以寻求专业法律人士的帮助，以确保合同的合法性和规范性。最终，当双方都对合同内容无异议后，可以正式签字确认，并各执一份作为后续履行的依据。