提起劳动仲裁支付公司一万元违约金这样的条款通常是无效的。下面我从法律角度给你详细解释一下：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十五条，除本法第二十二条（服务期）和第二十三条（竞业限制）规定的情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。这意味着，在一般情况下，用人单位不能与劳动者约定违约金条款，尤其是像提起劳动仲裁就需要支付违约金这样的条款。
条款性质分析：
- 提起劳动仲裁是劳动者维护自身合法权益的正当途径，如果用人单位通过约定违约金来限制劳动者提起劳动仲裁，这实际上是对劳动者合法权益的侵害，也违反了劳动法的立法目的和原则。
实际效力：
- 即使劳动合同中包含了这样的违约金条款，由于它违反了法律的规定，因此在法律上也是无效的。如果用人单位试图依据这样的条款向劳动者索取违约金，劳动者可以依法拒绝，并可以通过法律途径维护自己的权益。
综上所述，提起劳动仲裁支付公司一万元违约金这样的条款在法律上是无效的。如果你遇到了这样的情况，不用担心，你可以依法提起劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果你还有其他劳动法律方面的问题，也可以随时向我咨询。