当公司法人和老板不是同一个人时，如果你与公司之间发生了劳动争议，比如工资拖欠、工伤赔偿等，你仍然可以申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。以下是详细的解答和建议：

结论前置

你可以向公司（即法人实体）申请劳动仲裁，无论公司的法人代表和实际老板是否为同一人。

详细解答

1. 明确被申请人主体：

   • 在劳动仲裁中，被申请人通常是与劳动者建立劳动关系的用人单位，即公司本身，而不是老板个人或单纯法人。这是因为法人是法律上赋予公司民事权利能力和民事行为能力的组织，它代表了公司的整体。
   • 因此，即使公司的法人代表和实际运营老板不是同一人，你也应以公司为被申请人申请劳动仲裁。

2. 收集证据：

   • 为了证明你与公司之间的劳动关系以及公司的违法行为（如拖欠工资、未提供劳动保护等），你需要收集一系列证据。
   • 这些证据可能包括劳动合同、工资发放记录（如银行转账记录、工资条）、工作证、考勤记录、同事证言等。
   • 如果实际运营与营业执照登记不符，你还需要搜集如公司运营管理材料等证据，以证明真实的劳动关系。

3. 书写仲裁申请书：

   • 你需要详细写明申请人与被申请人的基本信息，仲裁请求（如支付拖欠工资、经济补偿等），并陈述事实与理由。
   • 仲裁申请书应当清晰、明确，并附上所有相关证据材料的复印件。

4. 选择仲裁机构并提交申请：

   • 根据劳动争议发生地或用人单位所在地选择有管辖权的劳动争议仲裁委员会。
   • 将仲裁申请书和证据材料一并提交给仲裁委员会，并按要求缴纳仲裁费用（部分地区可能免费）。

5. 参与仲裁庭审：

   • 按照开庭通知的时间、地点准时参加庭审。
   • 在庭审中清晰陈述案件事实，围绕仲裁请求进行阐述，并提供证据支持。
   • 针对被申请人的答辩意见和证据进行辩论和质证。

6. 等待仲裁裁决：

   • 仲裁机构应在受理后一定期限内（通常为45日内，复杂案件可延期）结束审理并作出裁决。
   • 仔细阅读裁决书内容，了解仲裁结果。对裁决不服的，可在规定期限内向人民法院提起诉讼。

注意事项

• 在申请劳动仲裁前，建议查阅公司注册文件、营业执照等，核实企业法人的身份和公司信息。
• 如果在仲裁过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。
• 保持所有相关证据的完整性和真实性，以便在需要时提供充分支持。

综上所述，即使公司法人和老板不是同一个人，你仍然可以向公司申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请过程中，请务必收集充分的证据并遵循正确的程序。