同时设置两个施工资质并禁止联合体投标，并不一定违法，但需具体分析招标文件的规定及相关法律法规。

一. 施工资质与联合体投标的关系

1. 施工资质的要求：在工程项目招标中，通常会要求投标人具备相应的施工资质。这是为了确保工程的质量和施工的安全。如果招标文件要求投标人同时具备两个施工资质，那么投标人必须同时满足这两个资质的要求。
2. 联合体投标：联合体投标是指两个或两个以上的法人或其他组织组成一个联合体，以一个投标人的身份共同投标。联合体各方应当签订共同投标协议，明确约定各方拟承担的工作和责任，并将共同投标协议连同投标文件一并提交招标人。

二. 法律法规的考量

1. 《招标投标法》的规定：根据《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例，招标人有权在招标文件中对投标人的资质、业绩、技术等提出要求。同时，也允许投标人组成联合体投标，但联合体各方应当具备承担招标项目的相应能力，并应当签订共同投标协议。
2. 违法性的判断：如果招标文件明确规定投标人必须同时具备两个施工资质，且未允许联合体投标，这并不直接构成违法。因为招标人有权根据项目的具体需求和特点，设定合理的投标人资格条件。然而，如果招标文件中的规定违反了相关法律法规的强制性规定，或者存在歧视性、排他性等不公平、不合理的条款，那么这样的规定就可能是违法的。

三. 实际情况的分析

• 如果招标文件的要求是合理的：即要求投标人同时具备两个施工资质是为了确保工程的质量和施工的安全，且未违反相关法律法规的强制性规定，那么这样的要求就是合法的。在这种情况下，禁止联合体投标也是合法的，因为招标人有权根据项目的具体需求来设定投标方式。
• 如果招标文件的要求存在违法或不合理之处：例如，要求投标人同时具备两个难以同时满足的施工资质，或者存在歧视性、排他性条款，那么这样的要求就可能是违法的。在这种情况下，禁止联合体投标也可能构成违法，因为这样的规定限制了投标人的竞争机会，违反了公平竞争的原则。

我建议：在参与招标活动时，投标人应仔细审查招标文件的规定，确保其合法性和合理性。如果认为招标文件中的规定存在违法或不合理之处，可以向招标人提出异议或向相关监管部门投诉。同时，投标人也可以根据自身实际情况和项目需求，考虑是否组成联合体投标，以提高中标的机会和项目的实施效果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。