公司让员工按手印并不一定构成违法行为，这主要取决于按手印的具体情境和所涉文件的内容。

在某些情况下，公司让员工按手印是合法且合理的。例如，在签订劳动合同、保密协议等重要文件时，按手印可以作为一种确认手段，表明员工对文件内容的认可和接受，同时也有助于保护双方的合法权益。这种情况下，按手印并不构成违法行为。

然而，如果公司强制员工在违背其真实意愿、侵犯员工合法权益或违反法律法规的文件上按手印，那么这种行为就属于违法行为。比如，公司要求员工按手印签署不合理的罚款协议、霸王条款等，这些行为都侵犯了员工的合法权益，因此是违法的。

因此，判断公司让员工按手印是否违法，需要综合考虑按手印的具体情境和所涉文件的内容。如果您认为公司要求不当或涉嫌违法，建议保存好相关证据，并及时向我咨询，我会为您提供专业的法律意见和帮助。