公司可以在特定情况下要求员工签名按手印，但必须符合法律规定且不得侵犯员工合法权益。具体分析如下：

1. 合法性基础
   根据《民法典》第143条，民事法律行为有效的条件包括：行为人具有相应民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或公序良俗。若公司要求签名按手印的行为符合上述条件（例如用于确认劳动合同、规章制度、考勤记录等合法文件），则具有法律效力。但需注意：

   • 劳动合同：根据《劳动合同法》第16条，劳动合同由用人单位与劳动者协商一致后签字或盖章生效，按手印并非法定必要条件，但若双方自愿且不损害权益，可作为补充确认方式。
     
   • 规章制度：公司通过民主程序制定的规章制度需公示或告知员工，若要求员工签字按手印确认已知悉，需确保制度内容合法且程序合规。
     

2. 禁止性情形
   公司不得以签名按手印为由侵犯员工合法权益，例如：

   • 强制或胁迫：若公司以扣工资、辞退等手段强迫员工签名按手印，可能构成《劳动合同法》第38条规定的“强迫劳动”，员工有权解除合同并主张赔偿。
     
   • 侵犯隐私：若要求员工在涉及个人隐私的文件（如健康证明、家庭信息）上按手印，需明确告知用途并取得同意，否则可能违反《个人信息保护法》。
     
   • 格式条款无效：若文件内容存在免除公司责任、加重员工义务的条款（如“自愿放弃加班费”），即使签名按手印，该条款也可能因违反《劳动合同法》第26条而被认定无效。
     

3. 实务建议

   • 公司角度：
     
     • 明确用途：在要求签名按手印前，向员工说明文件性质、目的及法律后果，确保员工知情且自愿。
       
     • 保留证据：对重要文件（如劳动合同变更协议）建议同时采用签字+按手印+公司盖章的方式，增强证据效力。
       
   • 员工角度：
     
     • 审慎对待：若对文件内容有疑问，可要求公司解释或咨询法律人士，避免盲目签字按手印。
       
     • 拒绝违法要求：若公司行为涉嫌强迫、欺诈或侵犯权益，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
       

总结：公司要求签名按手印本身不违法，但需以合法、自愿为前提。若您遇到具体情境（如公司强制按手印、文件内容存疑等），可直接向我咨询，我会结合细节为您分析风险及应对方案。