这涉及到合同履行与款项支付的问题，需具体分析合同条款及交易细节。

一. 分析合同条款

1. 合同约定的退款条件：首先，应详细查阅合同中关于退款的约定，包括退款的条件、流程、时限以及拒绝退款的情形。若合同中明确规定了退款申请被拒绝后款项如何处理，则应按照合同条款执行。
2. 款项到账的性质：需确认款项到账是基于合同的正常履行，还是因误操作或其他原因导致的。若款项到账是合同约定的正常流程，那么退款申请被拒绝后，款项的保留可能符合合同约定。

二. 考虑交易细节

1. 退款申请的合理性：分析退款申请是否被拒绝的合理性，即是否满足合同约定的退款条件。若退款申请合理且被拒绝，则需进一步考虑款项已到账的处理方式。
2. 款项到账后的处理：若款项已到账且退款申请被拒绝，应查看合同中是否有关于此情况的特别约定。若无特别约定，根据《民法典》的相关规定，当事人应当遵循诚实信用原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。在此情况下，我建议双方应协商解决，若协商不成，可通过法律途径维护自身权益。

三. 总结与建议

• 总结：申请退款被拒绝但钱已到账的情况，需结合合同条款及交易细节进行具体分析。若合同中有明确约定，则按约定处理；若无明确约定，则应遵循诚实信用原则，通过协商或法律途径解决争议。
• 建议：首先，与对方进行友好沟通，明确退款申请被拒绝的原因及款项已到账的处理方式。若无法达成一致，可咨询专业律师，通过法律途径维护自身权益。同时，在后续的交易中，建议更加谨慎地审查合同条款，避免类似纠纷的发生。

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