关于“公司非法经营员工会被判刑吗”这一问题，其核心在于判断员工在公司非法经营活动中的角色、行为及主观故意。以下是对此问题的全面分析：
结论前置：公司非法经营活动中，员工是否会被判刑需具体情况具体分析。员工若明知公司非法经营且积极参与、作用重要，会被认定为共犯，可能判刑；若员工仅是普通执行者，不知晓公司非法经营行为，且未起主导或关键作用，通常可酌情从轻或减轻处罚，不一定判刑。
员工明知且积极参与：
- 若员工明知公司从事非法经营活动，并积极参与其中，如帮忙售卖非法物品、提供财务支持或参与核心非法交易环节等，其行为可能构成共同犯罪。在此情况下，员工需承担刑事责任，可能面临被判刑的风险。判刑的具体轻重将依据员工在犯罪中的作用、情节及获利情况等因素由司法机关综合判定。
员工不知晓或未起关键作用：
- 若员工仅是公司的普通执行者，对公司的非法经营活动并不知情，或虽知情但未积极参与且未起主导或关键作用，其责任通常相对较轻。在此情况下，员工可能不会被判刑，或者即便被判刑，也可能酌情从轻或减轻处罚。
员工事后协助掩盖事实：
- 若员工在公司非法经营活动被查处后，协助公司掩盖非法经营事实或提供虚假证明等，其行为也可能构成犯罪，并面临被判刑的风险。
离职员工的责任：
- 对于已经离职的员工，若其在公司非法经营活动期间存在上述违法行为，离职并不影响其责任的承担。只要是在诉讼时效内，员工都需对其在公司上班期间的行为负责。
综上所述，公司非法经营活动中员工是否会被判刑取决于其在非法经营活动中的角色、行为及主观故意。因此，员工在入职前应仔细了解公司的业务范围及合法性，避免卷入非法经营活动；在职期间若发现公司存在非法经营行为，应及时向有关部门举报并寻求法律援助。