结论：公司非法经营时，员工是否会被判刑取决于其是否参与犯罪行为、主观心理状态以及涉案行为的严重程度等多个因素。若员工未参与且不知情，则通常不会被判刑；若员工明知并积极参与，则可能构成非法经营罪的共犯，面临刑事处罚。

详细分析：

1. 员工未参与且不知情的情况：

   • 如果员工对公司的非法经营活动并不知情，也没有参与到非法经营的决策、组织、策划或实施等任何环节中，只是按照正常的工作指令完成日常任务，那么通常不会被认定构成非法经营罪，因此也就不会被判刑。
   • 举例：假设某公司非法经营烟草制品，但某员工仅负责公司的日常行政工作，如文件整理、会议安排等，且对公司的非法经营行为一无所知，那么该员工通常不会被追究刑事责任。

2. 员工明知并积极参与的情况：

   • 员工如果明知公司的经营活动是非法的，却仍然积极参与其中，如协助进行非法采购、销售、财务处理等环节，并起到了重要作用，那么该员工就可能构成非法经营罪的共犯。
   • 量刑考量：在具体判断员工是否构成犯罪以及量刑轻重时，法院会综合考虑多种因素，包括但不限于员工在非法经营活动中的具体行为、参与程度、所起作用的大小、获利情况、悔罪表现以及对社会的危害程度等。
   • 举例：在非法经营烟草案件中，如果员工明知老板在未经许可的情况下销售烟草制品，却仍然帮助运输、销售或进行其他形式的协助，且达到一定数量和情节严重程度，那么该员工就可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役以及罚款等。

3. 员工作为直接责任人员的情况：

   • 如果员工属于公司中直接负责的主管人员或其他直接责任人员，并且参与了非法经营活动的决策、组织或实施等关键环节，那么也需要承担相应的刑事责任。
   • 法律责任：根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定，对于扰乱市场秩序，情节严重的非法经营行为，可处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，可处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。

建议与总结：

• 对于员工而言，应时刻保持警惕，不参与任何形式的非法经营活动，以免陷入法律风险。
• 如果员工发现自己所在的公司存在非法经营行为，应及时向相关部门举报，以维护市场秩序和自身合法权益。
• 在面临非法经营罪的指控时，员工应尽快寻求专业法律帮助，以便更准确地了解自己的法律地位和应对策略。

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