单位发现人事档案被处分，应首先进行内部调查，并根据调查结果采取相应的补救和纠正措施，同时确保符合相关法律法规。

一. 内部调查与处理

1. 立即启动调查：单位应成立专门小组，对人事档案被处分的情况进行详细调查，包括处分的原因、过程、涉及人员等。
2. 核实情况：通过查阅相关记录、询问涉事人员等方式，核实人事档案被处分的具体情况，确保事实清楚、证据确凿。
3. 采取补救措施：根据调查结果，单位应尽快采取补救措施，如恢复被错误处分的人事档案、对涉事人员进行教育或处分等。

二. 确保合规性

1. 遵守法律法规：在处理人事档案被处分的问题时，单位应严格遵守《中华人民共和国档案法》等相关法律法规，确保处理过程合法合规。
2. 保护员工权益：单位在处理过程中应充分保护员工的合法权益，如知情权、申诉权等，避免对员工造成不必要的损害。

三. 后续管理与预防

1. 加强档案管理：单位应加强对人事档案的管理，建立健全档案管理制度，确保档案的完整性、准确性和安全性。
2. 开展培训教育：定期对相关人员进行档案管理培训，提高档案管理水平和法律意识，预防类似事件再次发生。

我建议，单位在处理人事档案被处分的问题时，应秉持公正、公平的原则，确保处理结果合理合法。同时，加强档案管理，提高管理水平，是预防类似事件再次发生的关键。如有进一步需要，您可以继续咨询我。