公司倒闭后，已签署的工业用地转让协议仍然有效，但其履行可能受到公司倒闭这一事实的影响。以下是详细分析：

1. 协议有效性的法律依据：

   • 根据合同法的相关规定，依法成立的合同，自成立时生效，除非存在法定无效情形。公司倒闭并不属于合同无效的法定情形，因此，工业用地转让协议在公司倒闭后依然有效。

2. 公司倒闭对协议履行的具体影响：

   • 已履行部分：若协议已部分或全部履行，双方应基于诚实信用原则，对已完成的交易进行结算和确认。
   • 未履行部分：
     • 若公司进入破产程序，管理人有权决定继续履行或解除合同。若管理人选择继续履行，则合同相对方应继续履行协议义务；若管理人选择解除，则合同相对方可依破产法规定申报债权。
     • 若公司未经清算即注销，导致无法履行协议，债权人可要求有限责任公司的股东等清算义务人对公司债务承担清偿责任。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如果协议中存在欺诈、胁迫、恶意串通等法定无效情形，则无论公司是否倒闭，该协议均自始无效。
   • 若协议涉及土地使用权等需办理权属变更登记的，因公司倒闭导致无法完成变更登记的，可能会影响协议的实际履行，但不影响协议本身的效力。

4. 建议与后续行动：

   • 作为协议的一方，您应密切关注公司的破产清算进程，并根据管理人的决定采取相应的行动。
   • 若协议履行受阻，您可考虑通过法律途径维护自身权益，包括申报债权、提起诉讼等。
   • 在处理此类问题时，建议您咨询专业律师，以确保您的合法权益得到妥善保护。

综上所述，公司倒闭后，工业用地转让协议仍然有效，但其履行可能受到公司倒闭事实的影响。您应根据具体情况采取相应的法律行动，以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。