无罪申诉与控告诬告陷害罪可以同时进行。这两者在法律上并不冲突，而是两个不同的法律程序，可以分别进行。
无罪申诉：
- 无罪申诉是指被告人或其法定代理人、近亲属等，认为原判决、裁定认定的事实有错误，或者适用法律不当，或者审判程序违法，向有关司法机关提出请求，要求重新审判，以纠正原判决、裁定的错误。
- 这主要是基于被告人对原判决、裁定的不服，认为自己无罪或罪轻，而提出的一种救济途径。
控告诬告陷害罪：
- 诬告陷害罪是指捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究，情节严重的行为。
- 如果被告人认为有人对自己进行了诬告陷害，可以向有关司法机关提出控告，要求追究诬告人的刑事责任。
法律依据：
- 《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百五十二条：“当事人及其法定代理人、近亲属，对已经发生法律效力的判决、裁定，可以向人民法院或者人民检察院提出申诉，但是不能停止判决、裁定的执行。”
- 《中华人民共和国刑法》第二百四十三条：“捏造事实诬告陷害他人，意图使他人受刑事追究，情节严重的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；造成严重后果的，处三年以上十年以下有期徒刑。”
实际操作：
- 在进行无罪申诉的同时，如果发现有明确的诬告陷害行为，可以同时向有关司法机关提出控告。
- 司法机关会分别对这两个程序进行调查和处理，无罪申诉主要关注原判决、裁定的正确性和合法性，而控告诬告陷害罪则主要关注是否存在诬告陷害的犯罪事实。
综上所述，无罪申诉与控告诬告陷害罪在法律上是可以同时进行的，两者并不冲突。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的帮助，可以直接向我咨询。