如果申请工伤时用人单位否认存在劳动关系，您可以按照以下步骤来维护自己的权益：
首先，明确结论：
您需要通过收集证据、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式来确认劳动关系，进而进行工伤认定和赔偿申请。
接下来，详细分析：
- 收集证据：
- 工资支付凭证或记录（如银行转账记录、工资条）；
- 工作证、服务证等能够证明身份的证件；
- 考勤记录；
- 同事的证言；
- 其他能够证明劳动关系存在的材料（如工作邮件、聊天记录等）。
这些证据将有助于您在后续的法律程序中证明与用人单位之间的劳动关系。
申请劳动仲裁：
- 在收集到足够的证据后，您可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，请求确认劳动关系。
- 提交仲裁申请书及相关证据材料，并按照仲裁委的要求参与庭审。
- 仲裁委将根据双方提供的证据和陈述作出裁决。
提起诉讼：
- 如果您对仲裁结果不满，可以在规定的时间内向人民法院提起诉讼。
- 法院将全面审查案件事实，并根据相关法律规定作出判决。
工伤认定和赔偿申请：
- 一旦劳动关系得到确认，且您的伤情符合工伤认定条件，您可以向社会保险行政部门申请工伤认定。
- 提交工伤认定申请表、劳动关系证明材料、医疗机构诊断证明等相关材料。
- 认定为工伤后，您将依法享受工伤保险待遇，包括医疗费用、康复费用、停工留薪期间的工资福利等。
最后，给出建议：
- 在整个过程中，请保持冷静和理性，积极收集证据并寻求法律援助。
- 如果您遇到任何困难或疑问，可以随时向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律帮助。
记住，法律是保护劳动者权益的有力武器，只要您能够提供充分的证据来证明自己的劳动关系和工伤情况，就一定能够维护自己的合法权益。